犯罪事実の取り調べを吟味（ぎんみ）といった。吟味は、証拠調べよりも自白を得ることに主眼が置かれた。その取り調べでしばしば行われたのが、牢問である。牢問は、笞（むち）で打つ笞打ち、角材の上に座らせて石を抱かせる石抱き、頭を両足の間にはさんで手足を縛る海老責めがあった。現在から見れば拷問であるが、釣し責（つるしぜめ。釣り責ともいった）などの拷問とは区別された。牢問で自白すれば、吟味役人は供述書を作成した。これを「口書（くちがき）」といい、被疑者が罪を犯したことを認めた証文であるから、最後に「誤（あやま）り入り候」などと記し、爪印を押させる。これによって、被疑者が犯罪事実を認めたことになるから、以後は町奉行の吟味となる。