決済手段であるお金を受け払いしたり、証券を受け渡したりするための仕組み。決済システムのうち、資金を受け払いする仕組みが資金決済システム、また証券を受け渡すための仕組みが証券決済システム。コンピューター・ネットワーク等の物理的なものの他、契約、慣行上のルールや関係法令も包含する場合も。日本の主たる決済システムとしては、最終的な資金決済を行う日本銀行（日銀）の当座預金決済制度（日銀ネット当座預金系）、全国銀行協会（全銀協）等が運営主体である振り込み・送金等を担う内国為替制度（全銀システム）、外国為替取引の円決済を担う外国為替円決済制度（外為円決済システム）、および手形・小切手等の決済を担う手形交換制度（手形交換所）。証券決済システムでは日銀の国債振替決済制度（日銀ネット）、株式等の決済を担う証券保管振替制度（ほふり）。代表的な海外の決済システムでは、アメリカでは、日銀ネット当座預金系にあたる中央銀行（FRB）のFed Wire（Federal Reserve Communications Sysem）、外為円決済にあたるCHIPS（Clearing House Interbank Payments System）。同様に、ヨーロッパでは欧州中央銀行（ECB）のTARGET（Trans-European Automated Real-Time Gross Settlement Express Transfersystem）とEURO1。他には外為決済専門決済システムのCLS（Continuous Linked Settlement）などがある。