スーパー特区とも呼ばれ、革新的な医薬品や医療機器を作るために創設された特区の一つ。革新的技術の開発を阻害している要因を克服するため、研究資金の特例や規制を担当する部局との並行協議などを試行的に行うものと説明されている。初年度となる2008年、iPS細胞の研究など24件の課題が採択された。これに採択されると、開発早期の段階から厚生労働省や医薬品医療機器総合機構に薬事相談して、臨床開発のスピードアップにつながると期待されている。