選手契約、球団経営、試合運営などに関する規定。いわば「プロ野球界の憲法」。野球が文化的公共財として信頼を確保することなどを目的とする。日本プロ野球組織の審議機関である実行委員会がオーナー会議の承認を得て条項が決められる。2009年1月1日から新協約が発効し、コミッショナー、セ・パ両リーグの3事務所が統合。コミッショナーの権限を強化し、新事務局を監督・指揮する行政的な役割に変更した。さらにオーナー会議が最高議決機関に位置づけられた。