プロ野球12球団の2軍チームによるリーグ戦。イースタンリーグは西武、ロッテ、日本ハム、巨人、ヤクルト、DeNA、楽天の7球団、ウエスタンリーグは中日、阪神、オリックス、広島、ソフトバンクの5球団が所属する。従来は6球団ずつ分かれていたが、2004年の球界再編問題でオリックスが近鉄を吸収合併し、楽天が宮城県を保護地域として新規参入したことにより、いびつな構成となった。シーズン終了後にはイ、ウ両リーグの優勝球団同士によるファーム日本選手権が行われている。