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明治に入り、コレラ(10年)、赤痢(16年)などの伝染病が大流行。ドイツから帰国した北里柴三郎が、福沢諭吉の全面的な協力を受け、1892年(明治25)、芝公園内に日本初の伝染病研究所、大日本私立衛生会伝染病研究所を設立。赤痢菌発見の志賀潔なども在籍する世界的水準の研究所となった。
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