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内視鏡検査では、口から入れる消化器内視鏡と呼吸器内視鏡、肛門からの肛門鏡、直腸鏡、大腸内視鏡、排尿口からの膀胱鏡、さらに女性の場合の膣鏡、子宮鏡などが利用されている。脳室鏡、縦隔鏡、関節鏡、血管内用内視鏡もある。大腸がん検診で潜血のある者は全大腸内視鏡検査が推奨される。
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