環境改善や途上国でのトイレの衛生管理の支援などを目的として、日本トイレ協会から独立する形で2008年9月に発足した組織。9月12日に行われた発足会では、トイレットペーパーの消費量に関する調査発表や、オリジナル曲の「うんちっちのうた」の披露などが行われた。同研究所では、小学校や企業と連携して衛生や健康の教育を行うほか、海外では国際機関と連携してトイレの衛生改善などの活動を行っていく。今後は、法人化することも視野に入れているという。