ほぼ日本列島中央部の中世以後の時期の北海道社会は、アイヌ文化時代と呼ばれている。文化的には擦紋時代から継続する要素が多いが、その特徴的な遺跡は、チャシと呼ぶ一種の城館遺跡である。チャシは眺望の良い位置に築いて大規模な空濠で防御する。和人（日本列島中央部人）への抵抗で知られるシャクシャインの砦（北海道日高）のように軍事的性格が強いものと、遠矢第二チャシ（北海道釧路）のように大量のエゾシカが出土して交易品生産が予想されるものなどがある。チャシのほかに、神送りや土坑墓が知られている。