略号はJAAF。1911年に創設された日本国内の統括組織。現会長は横川浩。連盟事務所は東京都渋谷区神南の岸記念体育会館内にある。テレビ放映されるマラソン、駅伝など人気種目を抱え他競技団体より財政的に恵まれているが、有力選手の育成は企業が抱える実業団組織に負う部分が大きい。女子の長距離・マラソン、男女の競歩競技、男子のハンマー投げ、やり投げ、短距離リレー種目などは世界的水準を保っている。注目度が高いマラソンは、男女ともメディアが支援する国内選考レースが複数あることから、オリンピックのたびに代表選考が国民的な議論を呼ぶ。